根据《中华人民共和国慈善法》第八十条和《企业所得税法》第九条规定，企业发生的公益性捐赠支出，在年度利润总额12%以内的部分，准予在计算应纳税所得额时扣除。对当年超过会计利润12%以外的部分，允许在以后的三年内在计算应纳税所得额时扣除。
根据规定，市民政局每年分批会同市财政局、市税务局，对接受公益性捐赠的基金会等公益性社会团体的捐赠税前扣除资格进行联合确认，并将确认结果分别在上海市财政局网站(网址：https://czj.sh.gov.cn/)、国家税务总局上海市税务局网站(网址：http://shanghai.chinatax.gov.cn/)上进行公示。 上海九棵树艺术基金会是新设立的基金会，已向市民政局提交了公益性税前扣除资格的申请。基金会在获得公益性捐赠税前扣除资格并公示后及时告知捐赠企业，企业也可以在上述网站查询。企业在下一年4-6月汇算清缴上年度企业所得税时办理企业所得税减免税。
